喀什是南疆的交通枢纽，交通业比较发达。
　　航空 在喀什至乌鲁木齐之间，每天都有大型客机，来往飞行，当旅游旺季到来，每周还增加四个航班，为旅游者提供了极大方便。喀什到乌鲁木齐每天都有航班，21:30起飞，23:00到达乌鲁木齐。
　　铁路 喀什是南疆铁路的终点站，主要列车如下：K888次14:42分从喀什发车，次日14:52到乌鲁木齐；K886次13:22从乌鲁木齐发车，次日13:16分到达喀什。
　　公路 喀什公路四通八达，全区12个县（市）均通汽车。从喀什市向东北有公路通往克州、阿克苏、库尔勒、吐鲁番，再向北通往乌鲁木齐。从喀什市向东南有公路通往疏勒、英吉沙、莎车、泽普、叶城、和田，再向东可通往甘肃的敦煌和青海的格尔木，由叶城向南可通往西藏的阿里地区。从喀什市向南有中、巴国际公路，向北和向西有两条公路经吐尔尕特口岸通往独联体。 从乌鲁木齐坐傍晚5点的班车，第三天中午到达喀什。
　　除喀什市外，该地区其他地方的班车班次有限，交通可租用汽车或拦路搭乘过路车，但请注意安全。如果去塔什库尔干和红其拉甫口岸，请事先办好单位介绍信（如果未办理，可花十元钱请当地旅行社代开）并到喀什市内的色满路上的地区公安处去边防证（到了塔什库尔干还需办理另一张边境通行证进红其拉甫）。
　　市内交通 在喀什坐出租车起步价只要5元。从机场到宾馆，出租车费用为30元；从宾馆到机场，出租车费用为10元；到火车站也为10元。出了城市，出租车费一般为10元。