该寺坐北朝南共四进院落。第一进有天王殿，内供奉布袋和尚和铜铸四大天王造像。第二进有大雄宝殿，供奉释迦牟尼佛和文殊、普贤两菩萨，为明初造像。抢厦梁上悬挂乾隆御笔“法海真源”匾。第三进有观音阁（又称悯忠台），陈列历代石刻，阁后为毗卢殿，供奉明代铜制五方佛像，其中层为四方佛，佛面各向四方，上层为毗卢佛。再后 是大悲坛，陈列唐和五代人的写经，宋、元、明、清版经文。四进为藏经馆， 陈列东汉、东吴、北魏、北齐及隋唐石雕造像，其中以唐感享三年造像最为珍贵，而明代木雕佛涅槃像，长可十米，是北京最大卧佛。法源寺历经火灾、地震及战乱破坏，多次重修但寺址未变。