元代时，东直门一带曾为河道，明中期，仍可漕运，在此先后设立海运仓、北新仓储存漕粮。故南门为海运仓，北门为北新仓，结构呈“日”字形。明代初期官仓有严格的收支制度，收、放粮的容器也有严格规定。明代北京官仓，除用于政府各项开支外，还将部分粮食用于平粜和赈济。1900年八国联军进京后，强占粮仓。明、清两代官仓贮粮的历史结束。